Діагностичні та аналітичні пептиди для наукових досліджень

Діагностичні та аналітичні пептиди розвиток методів, дослідження імунологічних аналізів, картування епітопів, оцінка антитіл, дослідження зв’язування та аналітичні робочі процеси.

Однак сама по собі послідовність пептиду не визначає ефективність аналізу.

На кінцевий результат дослідження можуть впливати такі фактори, як чистота, розташування мітки, структура кінцевих груп, конструкція лінкера, метод кон’югації, розчинність та кількість, що поставляється.

Тому компанія ALLGROWPEPTIDE аналізує кожен проект відповідно до передбачуваного формату аналізу та технічних вимог.

Діагностичні та аналітичні пептиди

Пептиди, розроблені з урахуванням вимог аналізу

Ефективний пептид для аналізу повинен відповідати експериментальному методу.

Наприклад, іммобілізований пептид може потребувати спейсера, який відокремлює послідовність від поверхні тесту. Водночас пептид для виявлення може потребувати флуоресцентного або афінного мітки в місці, яке не блокує цільову ділянку.

Тому перед початком виробництва слід перевірити такі деталі:

  • цільова послідовність;
  • вид або ізоформа;
  • термінальні групи;
  • необхідна чистота;
  • формат аналізу;
  • маркер або кон’югат;
  • положення кріплення;
  • довжина лінкера;
  • вимога щодо розчинності;
  • кількість у флаконі;
  • аналітична документація.

Дослідницькі застосування пептидів для аналізу

Заявка на проведення дослідженняМожливий формат пептидуОсновні аспекти проектування
Розробка методу ІФАПептид без мітки, біотінільований або кон’югований з носіємЕкспозиція епітопів, чистота та властивості нанесення покриття
Картування епітопівБібліотека пептидів із перекриттямПокриття послідовності, перекриття та формат мікропланшета
Оцінка антитілЦільовий пептид та відповідна контрольна послідовністьСпецифічність та гомологія послідовностей
Дослідження з питань палітуркиПептид високої чистоти з опціональним міченнямТочність нанесення та положення етикетки
Розробка методів визначення активності ферментівПептид-носій із флуоресцентною групою або групою-гасителемРозташування розрізу та конструкція сигналу
Дослідження калібрувальної кривоїСтандартний матеріал із визначеним пептидомЧистота, склад та стабільність партії
Діагностичні та аналітичні пептиди

Розробка методів ELISA та імунологічних аналізів

Пептиди можуть використовуватися в імунологічних дослідженнях як антигени, конкуренти, матеріали для покриття, контрольні зразки або мічені реагенти для виявлення.

Однак дослідники повинні ретельно підбирати послідовність.

Послідовність з високою гідрофобністю може покривати поверхню інакше, ніж заряджений пептид. Так само мітка або білок-носій можуть впливати на доступність.

Отже, у процесі розробки слід враховувати як біологічну мішень, так і фізичний формат аналізу.

Згідно з опублікованими компанією GenScript рекомендаціями щодо чистоти, для проектів зі створення та тестування антитіл достатньо рівня чистоти вище 70%, хоча у випадках, коли важливими є фоновий рівень, специфічність або кількісні показники, може бути доцільним забезпечити вищий рівень чистоти.

Діагностичні та аналітичні пептиди

Пептиди для картування епітопів

Бібліотеки пептидів із перекриттям допомагають дослідникам вивчати, як антитіла або партнери зв’язування реагують на різні ділянки довшої цільової послідовності.

Спочатку цільову послідовність розбивають на коротші пептиди. Далі між сусідніми послідовностями створюють задане перекриття. Нарешті, пептиди розміщують в окремі флакони, пробірки, планшети або пули.

Отже, дослідники можуть порівнювати відповіді по всій послідовності.

Необхідний рівень чистоти залежить від конкретного аналізу. Наприклад, у опублікованих компанією GenScript рекомендаціях щодо бібліотек для деяких проектів з картування епітопів та виявлення біомаркерів вказано використання необробленого матеріалу, тоді як варіанти з вищим рівнем чистоти застосовуються у кількісних дослідженнях або в проектах, орієнтованих на розробку.

Мітки, лінкери та кон’югати

МодифікаціяПрикладМожлива мета дослідження
Етикетка «Affinity»БіотинДослідження методами захоплення, імобілізації або пул-дауну
Флуоресцентна міткаFAM, FITC, TAMRA, Cy3 або Cy5Виявлення, візуалізація або вимірювання сигналу
Кон'югація носіяKLH, BSA або OVAДослідження, пов’язані з антитілами
ПрокладкаAhx або лінкер PEGВідокремити послідовність від поверхні або мітки
Реактивна ручкаГрупа, сумісна з азидом, алкіном, цистеїном або малеімідомДослідження контрольованої кон’югації
Мітка «Фермент-субстрат»Пара флуорофора та гасителяРозробка методів визначення активності протеаз або ферментів

Документація з якості та аналітична документація

Аналітичний пакет повинен відповідати меті дослідження.

Для стандартних проектів ВЕРХ та мас-спектрометрія можуть стати гарною відправною точкою. Однак у проектах з розробки методів кількісного аналізу може також знадобитися визначення чистого вмісту пептидів, перевірка наявності протиіонів, аналіз води або оцінка певної кількості.

Елемент якостіМета
Аналіз методом ВЕРХОцінює хроматографічну чистоту
Масова спектрометріяПідтверджує молекулярну ідентичність
Чистий вміст пептидівЗабезпечує більш точне приготування розчину
Підтвердження послідовностіЗв’язує наданий матеріал із затвердженим проектом
Ідентифікація партіїПосилання на записи про пептид, що містять аналітичні дані та інформацію про упаковку
Інформація про аліквотиВказує кількість препарату, що міститься у флаконі, пробірці або лунці

Від концепції аналізу до доставки пептидів

1. Описати метод аналізу

Вкажіть формат аналізу, мішень, ділянку послідовності, вимоги до мітки, ступінь чистоти та необхідну кількість.

2. Огляд процесу проектування пептидів

Далі наша команда аналізує довжину послідовності, розчинність, експозицію епітопів, кінцеву структуру та можливі модифікації.

3. Підтвердіть технічні характеристики

Потім перевіряються послідовність, положення мітки, лінкер, кількість, чистота, результати тестування та упаковка.

4. Отримати та очистити пептид

Пептид синтезується відповідно до затвердженого плану проекту. Після цього застосовується відповідна стратегія очищення.

5. Провести аналітичні випробування

Валідування партії здійснюється за допомогою ВЕРХ, мас-спектрометрії та узгоджених додаткових випробувань.

6. Скомпілювати проект

Нарешті, пептид постачається у вибраному флаконі, пробірці, планшеті, збірному контейнері або в індивідуальній упаковці.

Таблиця з інформацією про проект

Необхідна інформаціяПриклад
ПослідовністьПовна послідовність пептиду та цільова ділянка
Тип аналізуELISA, зв’язування, фермент, картування епітопів або інший метод
МодифікаціяБіотин, флуорофор, носій або сполучна ланка
ЧистотаСира нафта, ≥80%, ≥90%, ≥95% або ≥98%
ФорматОкремий флакон, планшет, зразки-пули або набір з декількома пептидами
ДокументаціяCOA, ВЕРХ, МС або додаткові випробування
Діагностичні та аналітичні пептиди

Межа між використанням у наукових дослідженнях та діагностикою

Пептиди для аналізів дослідницького призначення не вважаються автоматично валідованими продуктами для in vitro діагностики, медичними виробами, клінічними калібраторами або затвердженими діагностичними реагентами.

Отже, на цій сторінці не слід стверджувати, що продукти компанії ALLGROWPEPTIDE здатні діагностувати, запобігати, контролювати або лікувати захворювання, доки конкретний готовий продукт не пройде необхідну процедуру регуляторного контролю та валідації.

Рекомендована формулювання:

Пептиди, описані на цій сторінці, постачаються для проведення кваліфікованих лабораторних досліджень та розробки тестів. Вони не є валідованими діагностичними засобами і не призначені для безпосередньої клінічної діагностики.

Поширені запитання

Пептидні суміші

Чи можете ви виготовляти пептиди для розробки методу ІФА?

Індивідуальні пептиди можуть оцінюватися для досліджень методами ІФА та імуноаналізу відповідно до вимог щодо послідовності, чистоти, мітки, кількості та упаковки.

Так, перед наданням цінової пропозиції можна переглянути обрані етикетки та варіанти розміщення лінків.

Так. Клієнти повинні вказати цільову послідовність, довжину пептиду, ступінь перекриття, ступінь чистоти та бажаний формат.

Відповідь залежить від чутливості аналізу, рівня фонового сигналу, вимог до концентрації та формату пептиду.

Ні. Це дослідні матеріали, якщо не виконано окремі нормативні вимоги та вимоги щодо валідації.

Розробка пептидів на основі вашого аналізу

Надішліть нам послідовність, що підлягає синтезу, тип аналізу, необхідний рівень чистоти, модифікацію, кількість та формат поставки.

Після цього наша команда ознайомиться з технічними вимогами та підготує пропозицію, розроблену спеціально для цього проєкту.

CTA