Диагностические и аналитические пептиды для научных исследований

Диагностические и аналитические пептиды содействие разработке методов, исследованиям в области иммуноанализа, картированию эпитопов, оценке антител, изучению связывания и созданию аналитических рабочих процессов.

Однако сама по себе последовательность пептида не определяет эффективность анализа.

На конечный результат исследования могут повлиять такие факторы, как чистота, расположение меток, структура терминала, конструкция линкера, метод конъюгации, растворимость и поставляемое количество.

Поэтому компания ALLGROWPEPTIDE рассматривает каждый проект с учетом предполагаемого формата анализа и технических требований.

Диагностические и аналитические пептиды

Пептиды, разработанные с учетом требований анализа

Эффективный пептид для анализа должен соответствовать используемому экспериментальному методу.

Например, для иммобилизованного пептида может потребоваться спейсер, отделяющий последовательность от поверхности матрицы. В то же время для детектирующего пептида может потребоваться флуоресцентная или аффинная метка, расположенная в таком месте, чтобы не блокировать целевую область.

Поэтому перед началом производства необходимо проверить следующие детали:

  • целевая последовательность;
  • вид или изоформа;
  • терминальные группы;
  • требуемая чистота;
  • формат анализа;
  • маркер или конъюгат;
  • положение крепления;
  • длина линкера;
  • требование к растворимости;
  • количество в флаконе;
  • аналитическая документация.

Исследовательские применения анализируемых пептидов

Заявка на проведение исследованияВозможный формат пептидаОсновные аспекты проектирования
Разработка метода ИФАПептид без маркировки, биотинилированный или конъюгированный с носителемРаскрытие эпитопов, чистота и особенности нанесения покрытия
Картирование эпитоповБиблиотека перекрывающихся пептидовПокрытие последовательности, перекрытие и формат пластин
Оценка антителЦелевой пептид и соответствующая контрольная последовательностьСпецифичность и гомология последовательностей
Исследования в области переплетаПептид высокой чистоты с опциональной меткойТочность нанесения и положение этикетки
Разработка ферментных анализовПептид-субстрат с флуоресцентной группой или группой-подавителемМестоположение разреза и конструкция сигнала
Исследование калибровочной кривойСтандартный материал с определённым пептидомЧистота, состав и стабильность партий
Диагностические и аналитические пептиды

Разработка методов ИФА и иммуноанализа

Пептиды могут использоваться в иммунологических исследованиях в качестве антигенов, конкурентов, материалов для покрытия, контролей или меченых реагентов для детектирования.

Однако исследователям следует тщательно подбирать последовательность.

Высокогидрофобная последовательность может покрывать поверхность иначе, чем заряженный пептид. Аналогичным образом, метка или белок-носитель могут изменять доступность.

Поэтому в процессе разработки следует учитывать как биологическую мишень, так и физический формат анализа.

В опубликованных компанией GenScript рекомендациях по чистоте проекты по созданию и тестированию антител соотносятся с уровнем чистоты выше 70%, хотя в случаях, когда важны фоновый уровень, специфичность или количественные показатели, может потребоваться более высокая степень чистоты.

Диагностические и аналитические пептиды

Пептиды для картирования эпитопов

Библиотеки пептидов с перекрывающимися участками помогают исследователям изучать, как антитела или партнеры по связыванию реагируют на различные участки более длинной целевой последовательности.

Сначала целевая последовательность разбивается на более короткие пептиды. Затем между соседними последовательностями создается заданное перекрытие. Наконец, пептиды распределяются по отдельным флаконам, пробиркам, планшетам или пулам.

Таким образом, исследователи могут сравнивать ответы по всей последовательности.

Требуемая степень чистоты зависит от конкретного анализа. Например, в опубликованных GenScript рекомендациях по созданию библиотек для некоторых проектов по картированию эпитопов и выявлению биомаркеров указывается использование сырого материала, тогда как варианты с более высокой степенью чистоты применяются в количественных исследованиях или при разработке новых препаратов.

Маркеры, линкеры и конъюгаты

ИзменениеПримерВозможная цель исследования
Этикетка «Affinity»БиотинИсследования по захвату, иммобилизации или выосаждении
Флуоресцентная меткаFAM, FITC, TAMRA, Cy3 или Cy5Обнаружение, визуализация или измерение сигнала
Конъюгация переносчикаKLH, BSA или OVAИсследования, связанные с антителами
РаспоркаЛинкер Ahx или PEGВыделить последовательность из поверхности или метки
Реактивная ручкаГруппа, совместимая с азидом, алкином, цистеином или малеимидомИсследования в области контролируемого соединения
Маркировка «фермент-субстрат»Пара флуорофора и гасителяРазработка методов анализа протеаз или ферментов

Документация по качеству и аналитике

Аналитический пакет должен соответствовать цели исследования.

Для стандартных проектов ВЭЖХ и масс-спектрометрия могут стать подходящей отправной точкой. Однако в рамках проектов по разработке количественных методов может также потребоваться определение чистого содержания пептида, проверка на наличие противоионов, анализ воды или оценка определённого количества.

Элемент качестваЦель
Анализ с помощью ВЭЖХОценивает хроматографическую чистоту
Масс-спектрометрияПодтверждает молекулярную идентичность
Чистое содержание пептидовОбеспечивает более точное приготовление раствора
Подтверждение последовательностиСоответствует предоставленным материалам и утвержденному проекту
Идентификация партииСодержит ссылки на записи об анализе и упаковке пептида
Информация об аликвотахОпределяет количество, поставляемое в одном флаконе, пробирке или лунке

От концепции анализа до доставки пептидов

1. Описать метод анализа

Укажите формат анализа, целевой ген, участок последовательности, требования к мечению, степень очистки и необходимое количество.

2. Анализ структуры пептида

Далее наша команда оценивает длину последовательности, растворимость, степень экспозиции эпитопа, структуру концевых групп и возможные модификации.

3. Подтвердить технические характеристики

Затем подтверждаются последовательность, положение метки, линкер, количество, чистота, результаты тестирования и упаковка.

4. Получить и очистить пептид

Пептид синтезируется в соответствии с утвержденным планом проекта. Затем применяется соответствующая схема очистки.

5. Проведение аналитических испытаний

Оценка партии проводится с помощью ВЭЖХ, масс-спектрометрии и согласованных дополнительных испытаний.

6. Скомпилировать проект

В заключение, пептид поставляется в выбранном формате упаковки: во флаконе, пробирке, планшете, пуле или в индивидуальной упаковке.

Таблица с информацией о проекте

Обязательные данныеПример
ПоследовательностьПолная аминокислотная последовательность пептида и целевой участок
Тип анализаИФА, связывание, фермент, картирование эпитопов или другой метод
ИзменениеБиотин, флуорофор, носитель или линкер
ЧистотаСырая нефть, ≥80%, ≥90%, ≥95% или ≥98%
ФорматОтдельный флакон, планшет, пул или набор с несколькими пептидами
ДокументацияCOA, ВЭЖХ, МС или дополнительные испытания
Диагностические и аналитические пептиды

Граница между исследовательским использованием и диагностикой

Пептиды для анализа, предназначенные для научных исследований, не считаются автоматически валидированными продуктами для диагностики in vitro, медицинскими изделиями, клиническими калибраторами или утвержденными диагностическими реагентами.

Поэтому на данной странице не следует утверждать, что продукты ALLGROWPEPTIDE способны диагностировать, предотвращать, контролировать или лечить заболевания, если конкретный конечный продукт не прошел необходимую процедуру регулирования и валидации.

Рекомендуемая формулировка:

Пептиды, описанные на этой странице, поставляются для проведения квалифицированных лабораторных исследований и разработки тестов. Они не являются утвержденными диагностическими средствами и не предназначены для непосредственной клинической диагностики.

Часто задаваемые вопросы

Смеси пептидов

Можете ли вы производить пептиды для разработки метода ИФА?

Индивидуальные пептиды могут оцениваться для использования в исследованиях методами ELISA и иммуноанализа с учетом требований к последовательности, чистоте, мечению, количеству и упаковке.

Да, перед составлением коммерческого предложения можно ознакомиться с выбранными этикетками и вариантами компоновки линкеров.

Да. Заказчики должны указать целевую последовательность, длину пептида, степень перекрытия, степень очистки и предпочтительный формат.

Ответ зависит от чувствительности анализа, допустимого уровня фонового сигнала, требований к концентрации и формата пептида.

Нет. Они являются исследовательскими материалами, если не были выполнены отдельные нормативные требования и требования по валидации.

Разработка пептидов для вашего анализа

Укажите целевую последовательность, тип анализа, требуемую степень чистоты, модификацию, количество и формат поставки.

После этого наша команда изучит технические требования и подготовит предложение с учетом особенностей данного проекта.

CTA