일반적인 선형 펩타이드에는 특정 실험에 필요한 모든 특성이 갖춰져 있지 않을 수 있다. 따라서 펩타이드를 검출하거나, 고정화하거나, 접합하거나, 고리화하거나, 안정화하거나, 분석적으로 구별할 수 있도록 기능기를 도입할 수 있다.
그러나 결합된 각 기구는 분자 구조를 변화시킵니다. 그 결과, 분자량, 소수성, 전하, 용해도, 정제 특성 및 분석 반응도 변화할 수 있습니다.
Bachem과 GenScript는 시판 중인 옵션으로 아세틸화, 아미드화, 비오틴화, 형광 염료 표지, 고리화, PEG화, 클릭 화학 결합부, 인산화, 지질화, 동위원소 표지, 운반체 접합 등의 변형 방법을 제시하고 있다.